Anonim
Image

Platforma paruošia kelią genomo sekos nustatymui kaip kasdieninei praktikai ligoninėse, diagnozuoti ir gydyti genetines ligas, įskaitant vėžį ir retas ligas, bei geriau gydyti naujagimius, kuriems yra sudėtingi sutrikimai.

Kai 2000 m. Buvo paskelbtas pirmasis žmogaus genomas, mokslo bendruomenė sutiko, kad jie kartu su pramone turi išsikelti tikslą - „1000dollarinį genomą“.

Jie tikėjo, kad kai genomo sekos nustatymas kainuos tik 1 000 JAV dolerių, bus įmanoma surinkti kiekvieno paciento, kuriam to prireikė, geresnio, personalizuoto gydymo, genomą.

n

Šiandien šis 1000 dolerių vertės genomas yra beveik realybė. Vis dėlto tampa akivaizdu, kad vien ekonomiškas sekos nustatymas nėra visas atsakymas į individualizuotos medicinos realizavimą.

Neapdorotus sekos duomenis paverčiant „žiniomis“ ir gydytojams naudinga informacija, reikia daug skaičiavimo ir saugojimo galios. Anksčiau genomo duomenų analizė ir saugojimas buvo per brangus ir galėjo užtrukti keletą savaičių.

Tyrėjai ir pramonės lyderiai Belgijoje dabar išsprendė šią genomo analizės problemą, padarydami viso genomo sekos nustatymo procesą ligoninėms ekonomišką ir efektyvų - ne tik mokslinių tyrimų, bet ir kasdieninės priežiūros pacientų gydymo tikslais.

Platformą sudaro kombinuota skaičiavimo klasteris ir „Western Digital“ debesų objektų saugojimo sistema „ActiveScale ™“, kuri palaiko smarkiai optimizuotą genomikos programinės įrangos platformą ir kuri prireikus taip pat gali patekti į debesį („BlueBee Genomics Platform“). Šis sprendimas gali apdoroti visą sekos sudarymo mašinos (48 genomų) išvestį per 48 valandas, tuo pačiu metu sekos nustatymo mašina turi gauti neapdorotus genomo duomenis.

„Digital Digital“ „ActiveScale“ sistema gali būti keičiama iki 63PB (neapdorota) vienoje vardų erdvėje ir iki 19 devynių duomenų yra ilgaamžė. Tai suteikia galimybę, duomenų ilgaamžiškumą ir mastelio didinimo galimybes, būtinas norint pasiekti „imec“ kraštutinius duomenis grindžiamus GAP tikslus - dabar ir ateityje.

Dėl vieningos prieigos prie duomenų projekto architektai gali supaprastinti „ActiveScale“ sąveiką su didžiulio genomo duomenų kiekio nustatymo ir analizės procesu. „Western Digital NVMe“ SSD diskai palaiko duomenų, reikalingų skaičiavimo klasterio apdorojimo galiai palaikyti subalansuotos sistemos projektavimui, spartą.